366 papers
Deze studie toont aan dat vitrificatie van neurale weefsels leidt tot een selectieve ondervertegenwoordiging van transcripten die coderen voor complexe membraan-geïntegreerde eiwitten, waarbij het hippocampusgebied gevoeliger is dan de cortex.
Hoewel DLMDA de DNA-opbrengst van FFPE-prostaattumoren aanzienlijk verhoogt en valse positieve CNA-artefacten voorkomt, leidt deze methode tot een verlies aan gevoeligheid voor het detecteren van copy-number alterations, wat de techniek geschikt maakt voor screening maar beperkt voor hooggevoelige toepassingen.
Deze studie evalueert de langetermijnstabiliteit van 44 RNA-nucleoside-standaarden bij verschillende bewaringstemperaturen, identificeert afbraakmechanismen en synthetische onzuiverheden, en biedt daarop gebaseerde richtlijnen voor de voorbereiding, opslag en kwaliteitscontrole om de nauwkeurigheid en reproduceerbaarheid van LC-MS-analyses van RNA-modificaties te waarborgen.
Dit onderzoek toont aan dat epitranscriptomische veranderingen, met name uridine-modificaties in een GUUUU-motief die geassocieerd zijn met post-transcriptionele regulatie, een cruciale rol spelen bij de fenotypische plasticiteit van vasculaire gladde spiercellen tijdens de ontwikkeling van atherosclerose.
De studie concludeert dat er geen significante verschillen in 2'-O-methylatielandscappen bestaan tussen cytosolische en ER-geassocieerde ribosomen binnen dezelfde menselijke celtypen, wat suggereert dat deze modificatie geen bepalende factor is voor de compartimentale lokalisatie of functie van ribosomen.
Dit onderzoek toont aan dat KDM2B, via zijn JmjC- en CxxC-domeinen, een cruciale regulator is van HIF-1-expressie en -activiteit die essentieel is voor celproliferatie en aanpassing aan hypoxie.
Deze studie onthult dat snel evoluerende effectorproteïnen van bladluizen, de zogenaamde bicycle-proteïnen, een saposine-achtige vouw vertonen die is ontstaan uit disulfide-gebonden voorlopers en een grote structurele diversiteit toont die waarschijnlijk dient om plantdoelen te targeten of immuunbewaking te ontduiken.
Dit onderzoek toont aan dat Zika-virusinfectie de gastheer-epitranscriptoom herprogrammeert door alternatieve polyadenylering te induceren, wat leidt tot de vorming van nieuwe RNA-isoformen die preferentieel worden gemethyleerd door METTL3 en zo de m6A-modificatie dynamisch herstructureren.
Dit onderzoek toont aan dat barcode-crosstalk bij ONT-multiplexsequencing, vooral bij lage DNA-inputs, sterk wordt verminderd door het nieuwe ONT-protocol en volledig wordt geëlimineerd door een huisprotocol met pooling na adapterligatie, waardoor kritische evaluatie van oudere datasets en het gebruik van aangepaste protocollen voor hoge nauwkeurigheid wordt aanbevolen.
Dit onderzoek toont aan dat het chromatine-remodellerende complex NuRD essentieel is voor het 'resetten' van enhancers via een twee-fasenproces na ERK-signaleren, waardoor een nieuwe, stabiele enhancer-topologie ontstaat die snelle en precieze transcriptiereacties op extracellulaire signalen mogelijk maakt.
Dit artikel beschrijft de ontwikkeling en optimalisatie van een verbeterde AID2-systeem voor snelle eiwitdepletie in prototrofe *Candida albicans*-stammen en *Candida auris*, inclusief nieuwe vectorconstructies, strategieën voor CRISPR/Cas9-gemedieerde tagging en richtlijnen voor de meest effectieve reagentia.
Dit artikel beschrijft een labelvrij, op toehold-gemedieerde strandverplaatsing gebaseerd DNA-logisch systeem op een 3D-geprint hybride papier-polymer platform dat PDGF-BB met hoge gevoeligheid en specificiteit detecteert voor de vroege diagnose van pre-eclampsie bij zwangere vrouwen.
Dit onderzoek analyseert de conformationele en moleculaire interacties van de SAM-I-riboswitch met zijn natuurlijke ligand SAM, de niet-functionele analoog SAH en de potentiële binder JS4 om inzicht te krijgen in de mechanismen die leidend zijn voor het ontwerp van nieuwe RNA-gerichte antibiotica.
Vitamine D3 vermindert stikstofmosterd-geïnduceerde dermale toxiciteit door de darmmicrobiota te hermodelleren, wat leidt tot een verhoogde productie van butyraat via het intestinale VDR-α-defensine-signaalpad.
Dit onderzoek identificeert een mutatie in de lusstructuur van de miR-3260-precursor in de zijderups *Bombyx mori*, die leidt tot een gebrek aan Dicer-verwerking en een transparante larvale huid, maar geen waarneembare fenotypische effecten veroorzaakt door verstoring van de juvenielhormoon-regulatie.
Deze studie identificeert en karakteriseert negen zware metaal-ATPase-genen (VrHMA) in de mungboon, onthult hun evolutionaire classificatie en structurele eigenschappen, en toont aan dat met name VrHMA5 een cruciale rol speelt in de metalen-homeostase en stressrespons onder blootstelling aan zink, cadmium en koper.
Dit onderzoek toont aan dat ribosomale stalling, die optreedt wanneer transitpeptiden de ribosoomuitgang verlaten, een cruciale regulatorische rol speelt bij het bevorderen van de efficiënte targeting van door de kern gecodeerde eiwitten naar chloroplasten in Arabidopsis thaliana.
Dit onderzoek toont aan dat cycline-afhankelijke kinasen, met name CDK2, cruciaal zijn voor Ebola-virusreplicatie en -transcriptie door het herschikken van het gastheerproteoom, wat deze enzymen tot veelbelovende antivirale doelen maakt.
Dit onderzoek identificeert functionele genetische varianten die geassocieerd zijn met de ziekte van Parkinson en aantoont dat deze varianten in dopaminerge neuronen de expressie van de genen SCARB2 en BAG3 beïnvloeden door transcriptiefactorbinding en chromatinetoegankelijkheid te verstoren.
Dit onderzoek identificeert lncOriL, een nieuw polyadenylerd mitochondriaal lncRNA dat, samen met specifieke transcriptie- en modificatiepatronen, niet alleen bij zebravissen maar ook bij andere teleosteiën en zelfs bij zoogdieren zoals de mens voorkomt, wat wijst op een universele expressie en regulatie in gewervelden.